高栏港经济区属珠江三角洲南部沉积区，明末清初才成陆。第四系地层发育，主要为全新世海陆交互相松散沉积，下伏基岩；陆上丘陵及岸外岛屿的岩性以花岗岩为主，其次为砂岩和贡岩。近岸水域的全新世松散沉积厚3-45米，表层以淤泥、淤泥混砂和淤泥质土为主。在南水、高栏、大芒、荷包诸岛环围的海区及岛间峡湾之间，基岩之上松散沉积厚达30米-50米，有的达80米，珠海电厂防波堤处钻至-20—-40米未见基岩。

二、资源

     珠江与南海潮水在高栏港经济区冲积成大片肥沃的滩涂和多个沙滩，岛与岛之间形成宽阔的中浅海渔场，横贯半个珠江口，海产资源和海岛旅游资源十分丰富，盛产鱼、虾、蟹、蚝、贝等。建国以来就是广东四大渔场之一，属于典型的临海经济区。